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滑桃樹不同器官伴生細(xì)菌多樣性的分子特征
應(yīng)用不依賴于培養(yǎng)的16S rRNA基因技術(shù),揭示滑桃樹根皮、莖皮以及種子伴生細(xì)菌的種類多樣性,為建立伴生細(xì)菌的宏基因組文庫奠定基礎(chǔ).基于我們新近發(fā)表的植物伴生菌富集方法,建立富集和未富集樣品的全長(zhǎng)16S rRNA基因文庫,隨機(jī)挑取至少100個(gè)克隆進(jìn)行酶切分型并測(cè)序,根據(jù)16S rDNA的部分序列推測(cè)其所屬伴生菌的種類.結(jié)果表明,所檢測(cè)的細(xì)菌克隆大部分屬于γ-Proteobacteria,有少量來源于α-Proteobacteria或放線菌(Actinobacteria),也包括不可培養(yǎng)或分類地位不明確的細(xì)菌.經(jīng)過富集,16S rRNA基因文庫中細(xì)菌克隆的比例和序列多樣性顯著增加,根皮的伴生細(xì)菌種類最為豐富,其次是成熟種子和莖皮;幼嫩種子16S rDNA文庫的細(xì)菌克隆比例較小(1.18%),說明幼嫩種子的伴生菌最少.
作 者: 王浩鑫 焦軍影 曾英 沈月毛 WANG Hao-Xin JIAO Jun-Ying ZENG Ying SHEN Yue-Mao 作者單位: 王浩鑫,焦軍影,WANG Hao-Xin,JIAO Jun-Ying(中國科學(xué)院昆明植物研究所,云南,昆明,650204;中國科學(xué)院研究生院,北京,100039)曾英,沈月毛,ZENG Ying,SHEN Yue-Mao(中國科學(xué)院昆明植物研究所,云南,昆明,650204)
刊 名: 云南植物研究 ISTIC PKU 英文刊名: ACTA BOTANICA YUNNANICA 年,卷(期): 2006 28(3) 分類號(hào): Q94 關(guān)鍵詞: 微生物富集 植物伴生菌 16S rDNA 微生物多樣性 滑桃樹 不可培養(yǎng)微生物【滑桃樹不同器官伴生細(xì)菌多樣性的分子特征】相關(guān)文章:
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