動態(tài)性狀基因座的復(fù)合區(qū)間定位

動態(tài)性狀因其廣泛性和重要性而備受動植物遺傳育種研究者關(guān)注.用分子遺傳學(xué)方法探索該類性狀的遺傳機(jī)制已成為一個極富挑戰(zhàn)性的研究課題.將關(guān)于時間(測定日期)的Legendre多項式鑲嵌在遺傳模型的每個遺傳效應(yīng)中,以刻畫QTL和協(xié)同因子對動態(tài)性狀變化過程的作用,從而建立動態(tài)性狀基因復(fù)合區(qū)間定位分析的數(shù)學(xué)模型.利用復(fù)合區(qū)間定位策略的優(yōu)勢,提高對控制動態(tài)性狀多個QTL的檢測效力.以F2設(shè)計群體為例,闡述了動態(tài)性狀基因復(fù)合區(qū)間定位的似然分析原理,推導(dǎo)了參數(shù)似然估計的EM法兩步求解過程.模擬實(shí)驗(yàn)證明,相同設(shè)計條件下,復(fù)合區(qū)間定位對分布在同一連鎖群上多個影響動態(tài)性狀QTL的檢測效果明顯好于區(qū)間定位;隨著協(xié)同因子數(shù)目的增加,復(fù)合區(qū)間定位不但能檢測出更多的甚至所有的QTL,而且對每個QTL分辨得更加清楚.在實(shí)際應(yīng)用過程中,應(yīng)針對動態(tài)性狀的變化規(guī)律,并考慮計算成本恰當(dāng)?shù)剡x擇協(xié)同因子數(shù)目.

作 者： 高會江 楊潤清   作者單位： 高會江(東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,哈爾濱,150030)

楊潤清(上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海,200240) 

刊 名： 科學(xué)通報  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE SCIENCE BULLETIN  年，卷(期)： 2006 51(13)  分類號： Q3  關(guān)鍵詞： 動態(tài)性狀   復(fù)合區(qū)間定位   Legendre多項式   極大似然估計   EM算法  

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