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人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的篩選
首次克隆到人的SBK1(homo sapiens SH3-binding domain kinase 1,SBK1)的cDNA序列,并通過(guò)生物信息學(xué)的手段,電子克隆到人SBK1的基因組DNA序列.人的SBK1是鼠SBK1的直系同源物,兩者基因組DNA結(jié)構(gòu)相似,均含有4個(gè)外顯子.人的sbk1基因ORF長(zhǎng)1 275 bp,編碼424個(gè)氨基酸,而鼠的ORF長(zhǎng)1 254 bp,編碼417個(gè)氨基酸.兩者編碼區(qū)的核苷酸序列同源性達(dá)87.7%,而氨基酸序列同源性達(dá)95.7%,在羧基端均有一個(gè)PV富集區(qū),推測(cè)其能與含有SH3結(jié)構(gòu)域的蛋白質(zhì)結(jié)合.將RT-PCR所獲得的長(zhǎng)度為1 610 bp的sbk1 cDNA序列搜索EST數(shù)據(jù)庫(kù),進(jìn)行電子延伸,最終獲得了約5kb的人sbk1全長(zhǎng)mRNA序列,它與鼠的sbk1全長(zhǎng)mRNA大小一致;通過(guò)比較基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)UniGene族Hs.97837實(shí)際上代表了sbk1基因UniGene族Hs.460471的3'UTR區(qū)域,而不是代表了一個(gè)新的UniGene族.采用酵母雙雜交技術(shù),以SBK1為"誘餌",獲得了與之相互結(jié)合的蛋白表皮生長(zhǎng)因子受體EGFR和核孤兒受體蛋白NR4A1,它們之間的具體功能關(guān)系有待進(jìn)一步研究.
作 者： 王平章 王欣 王峰 吳俊 WANG Ping-Zhang WANG Xin WANG Feng WU Jun 作者單位： 王平章,王峰,WANG Ping-Zhang,WANG Feng(國(guó)家人類(lèi)基因組北方研究中心,北京,100176)王欣,WANG Xin(中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所,北京,100005)
吳俊,WU Jun(國(guó)家人類(lèi)基因組北方研究中心,北京,100176;上海睿星基因技術(shù)有限公司,上海,201203)
刊 名： 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào) ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 年，卷(期)： 2006 22(4) 分類(lèi)號(hào)： Q71 關(guān)鍵詞： SBK1 克隆 酵母雙雜交 相互作用【人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的篩選】相關(guān)文章：
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