利用基因組文庫(kù)加速Xa23基因定位的染色體步移

用距離水稻抗白葉枯病基因Xa23 0.8 cM的EST標(biāo)記C189,擴(kuò)增Xa23的近等基因系CBB23的基因組片段(0.8 kb)為探針,篩選水稻明恢63的TAC文庫(kù)和廣陸矮4號(hào)的PAC文庫(kù),對(duì)獲得的7個(gè)陽(yáng)性克隆用酶切法和Tail-PCR法進(jìn)行末端片段分離,獲得15個(gè)末端片段, 用于感病親本金剛30和抗病親本CBB23之間的多態(tài)性檢測(cè),發(fā)現(xiàn)7個(gè)末端片段在雙親間有多態(tài)性,分別為69B、70N、81N、45B、45N、84N和84B.用這些末端片段作RFLP標(biāo)記,對(duì)金剛30/CBB23的F2群體進(jìn)行檢測(cè)和連鎖分析,結(jié)果表明這些標(biāo)記與Xa23的遺傳距離依次為0.4、0.4、0.4、0.5、0.6、0.6和1.1 cM.雖然69B、70N和81N與Xa23的遺傳距離均為0.4 cM,但序列比對(duì)揭示69B與70N的物理距離為35 kb,與81N為95 kb,69B距Xa23最近.三者與Xa23的遺傳距離雖然相同,但物理距離存在很大差異.這些末端片段標(biāo)記加密了Xa23基因一側(cè)的遺傳圖譜,并使其遺傳距離縮短到0.4 cM,加速了Xa23的定位進(jìn)程,為Xa23的分離克隆奠定了重要基礎(chǔ).討論了這種染色體步移方法的適用條件.

作 者： 王春連 陳樂天 曾超珍 張群宇 劉丕慶 劉耀光 樊穎倫 章琦 ZHAO Kai-jun 趙開軍   作者單位：   刊 名： 中國(guó)水稻科學(xué)  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE  年，卷(期)： 2006 20(4)  分類號(hào)： Q943.2 S511.03  關(guān)鍵詞： 水稻白葉枯病   抗性基因   基因定位   TAC文庫(kù)   PAC文庫(kù)   染色體步移  

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