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分子標(biāo)記法和形態(tài)學(xué)特征對杏仁栽培種及野生種基因型的遺傳關(guān)系構(gòu)建的辨別

時間:2023-05-02 22:41:21 生物醫(yī)學(xué)論文 我要投稿
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分子標(biāo)記法和形態(tài)學(xué)特征對杏仁栽培種及野生種基因型的遺傳關(guān)系構(gòu)建的辨別

應(yīng)用23個形態(tài)學(xué)特征,19個擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)引物組合,80個隨機擴增多態(tài)DNA(RAPD)引物和32個簡單序列重復(fù)(SSR)引物對,比較三種分子標(biāo)記法在29個杏仁栽培種和3個野生種遺傳關(guān)系構(gòu)建中的信息景和效率.根據(jù)預(yù)期雜合度的評價,與AFLPs和RAPDs相比,SSRs具有較高水平的多態(tài)性和較大的信息量.AFLPs預(yù)期朵合度值最低,但其辨別效率值最高,因為AFLPs能揭示每個反應(yīng)中的大量條帶,導(dǎo)致各種類型的多樣性指數(shù)均較高.三種分子標(biāo)記法對杏仁基因型的辨別效率均較高,只是SSRs無法辨別‘Monagha'和‘Sefied'杏仁基因型.三種分子標(biāo)記法基因型相似性相關(guān)系數(shù)統(tǒng)計上顯著,但SSR數(shù)據(jù)要低于RAPDs和AFLPs的值.盡管三種分子標(biāo)記法樹形圖拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)存在一些差異,但相似性水平均較高.SSRs、RAPDs和AFLPs的系統(tǒng)樹圖及其綜合數(shù)據(jù)都能依據(jù)地理散布反映大多數(shù)栽培種的關(guān)系.AMOVA檢測到每個地理組中栽培種和野生種的變異.輔助程序分析表明,實驗所應(yīng)用的標(biāo)記物數(shù)量足以保證基因相似性估計的可靠性和標(biāo)記法間的比較是有意義的.

作 者: Karim Sorkheh Behrouz Shiran Soghra Kiani Nazanin Amirbakhtiar Sadegh Mousavi Vahid Rouhi Shahram Mohammady-D Thomas M. Gradziel Lyudmyla V. Malysheva-Otto Pedro Martínez-Gómez   作者單位: Karim Sorkheh,Behrouz Shiran,Nazanin Amirbakhtiar,Sadegh Mousavi,Vahid Rouhi,Shahram Mohammady-D(Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Shahrekord University, Shahrekord 8818634141, P.O.Box 115, Iran)

Soghra Kiani(Scientific assistance of Payam-e-Nour University, Farokhshahr8831871337, Iran)

Thomas M. Gradziel(Department of Plant Science, University of California, Davis, CA 93616, USA)

Lyudmyla V. Malysheva-Otto(Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Corrensstr.3, Gatersleben 06466, Germany)

Pedro Martínez-Gómez(Department of Plant Breeding, CEBAS-CSIC, P.O. Box 164, Espinardo 30080, Murcia, Spain) 

刊 名: 林業(yè)研究(英文版)  英文刊名: JOURNAL OF FORESTRY RESEARCH  年,卷(期): 2009 20(3)  分類號: Q341  關(guān)鍵詞: 擴增片段長度多態(tài)性   隨機擴增多態(tài)DNA   簡單序列重復(fù)   種質(zhì)   遺傳關(guān)系   杏仁   Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLPs)   Random Amplified Polymorphic DNA (RAPDs)   Simple-Sequence Repeats (SSRs)   germplasm   genetic relationships   breeding   prunus dulcis  

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