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植物SSR引物開發(fā)策略簡述
SSR是一種優(yōu)秀的分子遺傳標(biāo)記,已經(jīng)廣泛應(yīng)用到遺傳多樣性檢測、遺傳種質(zhì)鑒定、遺傳連鎖圖譜構(gòu)建、基因定位與標(biāo)記輔助育種等多個(gè)領(lǐng)域.但SSR標(biāo)記應(yīng)用的前提是根據(jù)物種已知DNA序列設(shè)計(jì)特異引物,才能進(jìn)行PCR擴(kuò)增.對于大多數(shù)物種而言,目前獲得的基因組DNA及表達(dá)的cDNA序列還非常有限或者根本沒有.由此人們不斷的設(shè)計(jì)出各種方法以開發(fā)出盡可能多的SSR引物,本文簡要地介紹了基于序列數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)和發(fā)展SSR引物的方法,這對于全基因組序列已經(jīng)測序的或者已經(jīng)擁有豐富DNA數(shù)據(jù)的物種是非?旖莸牟呗.對于那些遺傳背景復(fù)雜或知之甚少或基因組數(shù)據(jù)有限的物種,本文也系統(tǒng)的介紹了傳統(tǒng)的文庫法、富集法等開發(fā)SSR引物的策略.進(jìn)一步的本文結(jié)合本實(shí)驗(yàn)室的研究經(jīng)驗(yàn),對FIASCO磁珠富集法和ISS-抑制PCR法進(jìn)行了比較.
作 者: 陳懷瓊 隋春 魏建和 Chen Huaiqiong Sui Chun Wei Jianhe 作者單位: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院和北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所,北京,100193 刊 名: 分子植物育種 英文刊名: MOLECULAR PLANT BREEDING 年,卷(期): 2009 7(4) 分類號: Q94 關(guān)鍵詞: SSR 引物開發(fā)策略 文庫法 富集法【植物SSR引物開發(fā)策略簡述】相關(guān)文章:
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