基于PNO基因序列分析隱孢子蟲種系發(fā)育關(guān)系

本文以核基因組的功能蛋白丙酮酸:NADP+氧化還原酶(pyruvate:NADP+ oxidoreductase,PNO)編碼基因作為研究對(duì)象,對(duì)本實(shí)驗(yàn)室分離保存的隱孢子蟲蟲株進(jìn)行擴(kuò)增測(cè)序,用ClustalX 1.81對(duì)擴(kuò)增序列與GenBank相關(guān)參考序列進(jìn)行比對(duì),用Paup4.0程序中鄰接法(Neighbor-joining method,NJ)、最大簡(jiǎn)約法(Parsimonv,MP)和最大似然法(Maximum Likelihood,ML)進(jìn)行聚類分析,以確定不同隱孢子蟲分離株之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系,并以18S rRNA和HSP70基因構(gòu)僵的基因樹作參照,進(jìn)而評(píng)價(jià)PNO這一基因座是否適合作為隱孢子蟲基因分型和進(jìn)化關(guān)系分析的基因座.結(jié)果表明通過(guò)PNO構(gòu)建的進(jìn)化樹將隱孢子蟲分為2大類:Cryptosporidium bailey和C.meleagridis處于一個(gè)分枝,C.hominis、C.parvum牛基因型和C.parvum鼠基因型處于另一個(gè)分枝上.不同隱孢子蟲之間的同源性介于95.0%～100%,能有效區(qū)分隱孢子蟲不同基因型.因此,PNO基因序列也適合作為隱孢子蟲分離株種系發(fā)育的遺傳標(biāo)記.

作 者： 王進(jìn)產(chǎn) 張龍現(xiàn) 趙金鳳 寧長(zhǎng)申 菅復(fù)春 WANG Jin-Chan ZHANG Long-Xian ZHAO Jin-Feng NING Chang-Shen JIAN Fu-Chun   作者單位： 王進(jìn)產(chǎn),WANG Jin-Chan(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院,鄭州,450002;洛陽(yáng)普萊柯生物工程有限公司,河南洛陽(yáng),471000)

張龍現(xiàn),趙金鳳,寧長(zhǎng)申,菅復(fù)春,ZHANG Long-Xian,ZHAO Jin-Feng,NING Chang-Shen,JIAN Fu-Chun(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)牧醫(yī)工程學(xué)院,鄭州,450002) 

刊 名： 寄生蟲與醫(yī)學(xué)昆蟲學(xué)報(bào)  ISTIC 英文刊名： ACTA PARASITOLOGICA ET MEDICA ENTOMOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2008 15(1)  分類號(hào)： Q96  關(guān)鍵詞： 隱孢子蟲   丙酮酸   NADP+氧化還原酶   基因分型   種系發(fā)育關(guān)系  

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