植物查爾酮異構(gòu)酶的生物信息學(xué)分析

采用生物信息學(xué)方法和工具對GenBank中的洋蔥、豌豆、番茄和茶等植物的黃酮類化合物合成關(guān)鍵酶查爾酮異構(gòu)酶(CHI)的核酸和氨基酸序列進行了比對、分析和建模,進而對其分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、亞細胞定位、蛋白轉(zhuǎn)運肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、疏水性、分子系統(tǒng)進化、蛋白質(zhì)二級和三級結(jié)構(gòu)等重要參數(shù)進行了預(yù)測和推理.結(jié)果表明:該類酶基因的全長包括5'、3'非翻譯區(qū)和一個開放閱讀框,無蛋白轉(zhuǎn)運肽,且定位于細胞質(zhì)基質(zhì),是一個疏水性蛋白,二級結(jié)構(gòu)均以隨機卷曲和α-螺旋為主要構(gòu)件,洋蔥和豌豆的CHI三維建模成功.

作 者： 雷桅 鄒祥 向陽 湯紹虎 孫敏 LEI Wei ZOU Xiang XIANG Yang TANG Shao-hu SUN Min   作者單位： 雷桅,向陽,湯紹虎,孫敏,LEI Wei,XIANG Yang,TANG Shao-hu,SUN Min(西南大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,三峽庫區(qū)生態(tài)環(huán)境教育部重點實驗室,重慶,400715)

鄒祥,ZOU Xiang(西南大學(xué)藥學(xué)院,重慶,400715) 

刊 名： 北方園藝  PKU 英文刊名： NORTHERN HORTICULTURE  年，卷(期)： 2008 ""(2)  分類號： Q946.5 Q558  關(guān)鍵詞： 查爾酮異構(gòu)酶   生物信息學(xué)   黃酮類化合物  

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