- 相關(guān)推薦
柔性原子受體模型(FLARM)
柔性原子受體模型(Flexible Atom Receptor Model,FIARM)方法使用了改進(jìn)的遺傳算法(IGA),比傳統(tǒng)的受體模型方法具有更快的計(jì)算速度;FLARM受體模型中的原子空間坐標(biāo)在遺傳演化過(guò)程中是可變的,避免了不合適的起始位點(diǎn)對(duì)模型的影響;另外,FLARM用增加空原子權(quán)重的方法,可以生成不完全封閉的、允許有大段空區(qū)域的受體模型,這樣的模型能更好地模擬實(shí)際受體的結(jié)構(gòu),并且容易和藥效團(tuán)模型找到對(duì)應(yīng)關(guān)系.我們用FLARM方法分別計(jì)算了甾類化合物體系的CBG蛋白親和性和1,1,3-三氧-2H,4H-噻吩并[3,4-e][1,2,4]噻二嗪衍生物(TID)體系的抗HIV-1活性,計(jì)算結(jié)果表明FIARM生成的虛擬受體模型對(duì)配體分子的活性具有較高的預(yù)測(cè)能力,在此虛擬受體模型的基礎(chǔ)上還可以進(jìn)一步分析虛擬受體分子與配體分子的相互作用機(jī)制,對(duì)真實(shí)受體分子結(jié)構(gòu)的活性位點(diǎn)進(jìn)行初步預(yù)測(cè).
作 者： 裴劍鋒 周家駒 作者單位： 中國(guó)科學(xué)院過(guò)程工程研究所,北京,100080 刊 名： 化學(xué)學(xué)報(bào) ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA CHIMICA SINICA 年，卷(期)： 2002 60(6) 分類號(hào)： O6 關(guān)鍵詞： 柔性原子受體模型 遺傳算法 甾類化合物 TTD 藥物設(shè)計(jì)【柔性原子受體模型(FLARM)】相關(guān)文章：
V模型中相干場(chǎng)位相對(duì)原子自發(fā)輻射的影響04-26
雙光子Jaynes-Cummings模型中運(yùn)動(dòng)原子與光場(chǎng)的糾纏特性04-27
含腔場(chǎng)損耗的J-C模型中的場(chǎng)和原子壓縮效應(yīng)04-26
《分子和原子》教案03-05
多級(jí)評(píng)分模型中的分部評(píng)分模型04-26
新型智能仿生模型-蟻群模型04-27
非柔性結(jié)構(gòu)太空梯的構(gòu)想04-26
柔性撲翼的氣動(dòng)特性研究04-27
核受體LXR在糖代謝中的作用04-26