球狀蛋白質分子中氨基酸緊密接觸對性質的研究

采用CSU軟件(Contacts of structural units),對61種球狀蛋白質分子中氨基酸緊密接觸對(Residue-residue contact)進行了研究.重點研究了不同氨基酸在形成遠程緊密接觸對(Long-range contact)和近程緊密接觸對(Short-range contact)時的不同能力.發(fā)現(xiàn)氨基酸Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(疏性氨基酸,H)比較容易形成遠程緊密接觸對,氨基酸Glu,Gln,Asp,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(親水氨基酸,P)比較難形成遠程緊密接觸對,而氨基酸Ala,Gly,Thr,His(中性氨基酸,N)在形成遠程緊密接觸對時能力一般.它們平均每個氨基酸可形成6.03,3.64和4.43個遠程緊密接觸對.同時它們在形成近程緊密接觸對時能力非常接近,平均每個氨基酸可形成的近程緊密接觸對數(shù)目在2.34～2.85變化,差別非常小.親水氨基酸(P),中性氨基酸(N)和疏水性氨基酸(H)在蛋白質分子結構穩(wěn)定性上起著不同的作用.

作 者： 陳進 李靖 章林溪 姜舟婷 夏阿根 葉高翔 趙得祿   作者單位： 陳進,李靖,章林溪,姜舟婷,夏阿根,葉高翔(浙江大學物理系,杭州,310028)

趙得祿(中國科學院化學研究所分子科學中心,北京,100080) 

刊 名： 高分子學報  ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA POLYMERICA SINICA  年，卷(期)： 2003 ""(2)  分類號： O6  關鍵詞： 球狀蛋白質   緊密接觸對   CSU軟件   折疊  

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